Intézményünk a Markusovszky Egyetemi Oktatókórház Vas vármegyében az egyetlen, széles szakmai spektrummal rendelkező kórház, mely meghatározó szerepet tölt be a Nyugat-dunántúli régió betegellátásában is. A Központi Telephely Szombathelyen található.
Intézményünk 1929-ben létesült és ugrásszerű fellendülést jelentett a megye és Szombathely város, sőt az egész Nyugat-Dunántúl egészségügyi ellátásában. A kórházat a nagy formátumú kórházszervező Dr. Pető Ernő alapította. A kórház a két világháború között a megye határain túl is ismert, jó hírű gyógyintézetté fejlődött, és a második világháború után tervszerű, céltudatos gyógyító és tudományos munkája eredményeként megyei kórházunk az ország egyik legjelentősebb vidéki kórházává vált.
1955. január 1-én a kórház akkori vezetése a kórház névadójaként Markusovszky Lajost választotta, akinek végső nyughelye a mai Vasegerszegen található. Így a névadó választásnak helyi gyökerei is voltak. A hetvenes évek végén a kórház már regionális feladatokat is ellátó vezető egészségügyi intézmény.
2007. február 15.-én kórházunk egyesült a szentgotthárdi Vas Megyei Rehabilitációs Kórház és Gyógyfürdővel.
2013.01.15.-én egyesültünk a körmendi Batthyány-Strattman László Kórházzal, majd 2017. január 01.-én a celldömölki Egyesített Kemenesaljai Kórházzal, kialakítva így két új városi telephelyet.